Не выплачивают больничные.

Какая сумма у вас в дговоре прописана, и какая на руки вам выплачивается? Если суммы совпадают, налог не удерживается. Хотя, это, конечно, и странно

С бухгалтерией мы не связаны, все расходы и в том числе з/п берем себе сами из кассы. Суммы разные, в договоре белая з/п, а получаем намного больше...

Оклад, он не изменился после оформления. Тогда работодатель из своего кармана платит налог?

больничные должны расчитываться исходя из з/п в трудовом договоре. 13 процентов вычитаются из нее же. Чтобы узнать с какой суммы вычитаются 13 проц потребуйте у работодателя справку 2 НДФЛ, которую он обязан вам предоставить по вашему требованию

может в вашей фирме упрощенная система налогообл. При ней взносы в соцстрах не производятся. Больничный должен уплачиватся из денег работодателя. Он вам фигу и показал. ндфл должен все равно удерживаться, но он может такой что вычеты на детей его и перекрывают.